综合管理科 : 办公室事务、工资管理、公积金管理

项目规划与预算办公室 : 年度预算、决算，经费分解、拨付等业务

会计核算科 : 教育经费业务核算

资金结算科 : 资金收、付、转及国库支付业务

后勤基建财务科 : 后勤会计业务核算、基建会计业务核算等

收费管理科 : 学生收费与缴费管理业务

科研经费管理科：科研经费会计核算业务、相关税票的管理等

信息化建设管理科：财务信息化建设业务等

财务监督科：二级核算单位财务监督